Если вспоминать о том, как же появился этот банк, необходимо поговорить о молодости Ходорковского и его деятельности в 1987 году. В то время Ходорковский как раз создал Межотраслевый центр научно-технического творчества молодежи (НТТМ) при Фрунзенском райкоме ВЛКСМ ( Всесоюзного ленинского коммунистического союза молодежи). Казалось бы, хорошее дело. Однако вместо того, чтобы двигать научно-технический прогресс, организация Ходорковского нашла в этом отличный способ заработка.
НТТМ занимался импортом и сбытом компьютеров, варкой джинсов, сбытом алкогольной продукции, в том числе поддельной и многим другим. В те времена все это приносило немалые деньги.
Однако основным заработком организации стало так называемое обналичивание средств. Заключалась операция в том, что государственные предприятия имели на счетах суммы под определенные расходы, однако «снять» их со счёта просто так они не могли.
Именно эти деньги и обналичивал НТТМ. Предприятие якобы вкладывало деньги в разработку центром чего-либо для предприятия, но по факту ничего, конечно же, не происходило, подписывались бумаги и владельцы предприятий забирали деньги себе, отдавая комиссию «за услугу» НТТМ. Причём, по началу эта комиссия составляла целых 90% от суммы.
Таким нехитрым образом к 1988 году организация имела оборот торгово-посреднических операций на 80 миллионов рублей. Собственно, именно эта деятельность и послужила стартом для создания Ходорковским межбанковского объединения «Менатеп».
Благодаря связям, НТТМ уже в 1989 году создает кооперативный банк КИБ НТП, которое позже выкупит НТТМ у Моссовета и будет переименовано в «Менатеп». Ходорковский станет председателем правления, а в свои заместители назначит Невзлина и Голубовича.
Тогда же он наладит связи с правительством и будет представлен Горбачёву, с личного разрешения которого «Менатеп» откроет расчетные счета Фонда ликвидации последствий аварии на Чернобыльской АЭС. И снова, казалось бы, достойное дело, однако 60%собранных средств разойдутся по различным структурам компании и большая чась денег будет расхищена, чему имеются документальные подтверждения.
С приходом к власти Бориса Ельцина и распадом СССР «Менатеп» примет активное участие в «приватизации», присвоив себе огромную часть государственных предприятий. Основными направлениями будут определены текстильная и пищевая промышленность, строительные материалы, цветная металлургия и производство минеральных удобрений. Именно «приватизация» создаст в России будущих олигархов.
В 1992 году «Менатеп» объявит о намерении создать "финансово-промышленную олигархию", призванную лобировать интересы богатой клиентуры в госструктурах. А через год безоговорочно примет сторону Ельцина, оставшись одним из немногих банков, спонсирующих президента в тот год. Существует мнение, что именно за это «Менатеп» включат в коммерческую схему "нефть-сахар" между Россией и Кубой и предоставят ему правительственные гарантии.
В 1995 году в ходе тех самых залоговых аукционов «Менатеп» приобретет компанию «ЮКОС», вторую по величине нефтяную компанию России, став владельцем 78% акций. А к осени 1996 года в руках команды Ходорковского будет уже 90% акций данного предприятия. Но, это уже начало совсем другой истории, а что же стало с «Менатепом»?
А «Минатеп» не переживёт дефолт 1998 года. Оставшись в долгах вкладчикам (38 миллионов долларов) и инвесторам (около 600 миллионов долларов), и проведя безрезультатное слияние с «ОНЭКСИМ-банком» и «Мост-банком», руководство переведет активы и документы в «Доверительный инвестиционный банк» и в «МЕНАТЕП-Санкт-Петербург». Позже переговоры с инвесторами будут провалены, а вкладчики останутся ни с чем. И ничего Ходорковскому за это не будет.
24 мая 1999 года «КамАЗ», перевозящий документы банка «МЕНАТЕП-Санкт-Петербург» попадет в таинственную аварию, утопив всю его поднаготную, включая операции по счетам клиентов, договоры кредитного управления, распоряжения и приказы банку и прочие бумаги. В октябре того же года банк будет признан банкротом.